台风会使养殖网箱内的鱼类碰撞、擦伤，易发生继发细菌性溃疡病等病害，使围塘养殖的养殖环境发生突变，如盐度、 PH值急剧下降。环境突变使原有生态平衡特别是微生态平衡打破，细菌等病原生物以及氨氮、硫化氢等有害物质大量产生，鱼虾蟹易产生应激反应，导致疾病暴发和流行。因此，在台风过后，应采取如下措施：
一、修复设施：及时修复被毁坏的堤坝、池埂、闸门、网箱养殖设施、拦鱼和防逃设施、育苗设施及厂房和供电等基础设施。滩涂养殖要开沟排(积)水，整理涂面工作。
二、鱼病预防：
台风暴雨期间，围塘水体的溶解氧因为池水上下层对流，阳光少，光合作用差，极易导致池底溶解氧不足，同时，水温、pH值、盐度也会降低。而养殖水体中的溶解氧偏低的话，池底的有机质无法正常进行氧化分解，会产生更多的氨态氮与亚硝酸盐等有毒物质，对养殖品种产生伤害，极易导致病害的发生。
1、台风、暴雨引起池塘水质的主要变化：
(1)因为暴雨，大量淡水注入池塘，引起池水盐度急剧下降。
(2)、因为暴雨，大量淡水注入池塘，引起池水pH急剧下降。
(3)、因为淡水大量注入池塘，引起水温下降较大。
(4)、因为淡水大量注入池塘，引起海淡水分层现象，使池塘底部水层溶氧下降。
(5)、因盐度、pH、温度急剧变化，引起池塘水体原来平衡的藻相、菌相失衡。原来水体的藻类可能死亡，有益细菌可能死亡，病原菌可能大量繁殖，大量陆地细菌可能被带入池塘。
(6)、因大风引起池塘涌浪，大浪淘底，使原来沉积在池底的硫化氢、氨氮、残饵、动植物尸体、排泄粪便等有害物质被淘起，引起水质败坏，生物耗氧量上升，特别是使池塘底层水质更差。
(7)、因大风、涌浪使鱼、蟹受到惊吓，引起鱼、蟹应激反应。
这里主要讲了七点变化，还不包括陆地有害化学药物、污水、大地沉积物、粪便、农药等有害物质随大量淡水冲入池塘可能引起的危害。
2、台风、暴雨过后虾、蟹养殖可能出现的主要病害：
上述七大变化足以引起养殖虾、蟹发生“应激反应”。“应激反应”就是虾、蟹通过神经、体液的生理作用，调动身体的每个器官，来应对环境的突变。“应激”是要消耗大量体能的，体能下降了，免疫能力就会下降，原来潜伏在体内的隐性病害就会抬头，有害细菌就可能趁虚而入，引发病害。
(1)、对虾病毒病：虾苗携带病毒的几率非常高，再加上水体中的桡足类、甲壳类、多毛类等都是对虾病毒的可能携带者，因此池塘养殖对虾或多或少都可能携带病毒。对虾病毒携带量的多少，有一个量变到质变的过程，当对虾携带少量对虾病毒时，只要池塘养殖环境适宜，是不会暴发对虾病毒病的，此时对虾活动正常，生长正常。如果池塘养殖环境变坏了，对虾免疫功能下降了，病毒才会存对虾体内大量复制，引起对虾大批死亡。因台风、暴雨的影响，对虾极有可能引发病毒病。
(2)、海水蟹可能被淡水呛死或患水肿病：台风、暴雨造成的水体盐度急剧下降，是一个突变的现象，海水蟹在短时间内通过调节身体功能来适应渗透压的巨变，如体质差、调节不过来，就会被淡水呛死。如果勉强应付过来，暴雨过后海水蟹很容易得水肿病。我们有这样的经验，每次大暴雨后，大量淡水注入池塘后，海水蟹就会发生一次普遍的疾病，这个疾病很有可能是水肿病。水肿病不是病毒病，也不是细菌性疾病，更不是寄生虫性疾病，而是海水蟹不适应渗透压剧变的生理机能不适应症。水肿病的症状是：正常的海水蟹的步足基部关节处比较紧实，可灵活转动。患水肿病的海水蟹步足基部关节处呈水肿状，表皮松垮，似脱节现象。
(3)虾、蟹细菌性病害：台风、暴雨过后池塘内病原菌大量繁殖：虾、蟹因应激反应体能消耗，使免疫功能下降;池塘水质环境恶化，特别是池塘底层水体溶氧下降;一般情况下，虾、蟹在连续溶氧量低于3毫克/升的条件下超过18小时以上发病的几率是非常高的。这样，疾病发生的三要素都已具备，虾、蟹极有可能发生细菌性疾病，主要是弧菌病。
(4)网箱养殖鱼类的细菌疾病：台风会使养殖网箱内的鱼类碰撞、擦伤，易发生继发细菌性溃疡病等病害。
(5)、寄生虫病的暴发：台风过后水温回升很快，加上养殖池内水质突变，养殖的水生动物很容易发生寄生虫病。
3、台风、暴雨过后的养殖疾病防治工作：
(1)、围塘养殖的疾病防治：
①及时换水：通过几次换水逐渐将塘水pH、盐度调节到鱼虾蟹贝正常的生理范围内，第一次排水以排去表层水为好，排水也不能操之过急，不可一次将池水排出滩面(尤其是晴热的白天)，否则对蟹类、贝类都会有一定影响。
②施药：进排水后，对养殖池水、进排水沟进行一次全面的消毒处理。可选用漂白粉、二氧化氯、溴制剂、碘制剂等。消毒后过几天，可投放水质、底质改良剂，如沸石粉(25～50千克/亩)、生石灰(8～15千克/亩)以及商品底质改良剂(如底净宝等)。集约化养殖池应补充有益微生物制剂。
③饵料中添加Vc、免疫多糖、保肝健、免疫多肽进行投喂，提高海水蟹抗应激能力。为了预防细菌性疾病，给海水蟹投喂1～3次蟹病康;如果已经发生细菌性病害，则还需另外添加抗菌药物。
④防止缺氧：台风后，由于池底泛起，藻类死亡，遇到闷热天、尤其是早晨，易引起缺氧，应做好预防工作，应增加增氧机的增氧时间，必要时，在晚上8点钟左右，投放一些增氧剂如粒粒氧等。这不仅可以增加池塘底部的溶解氧，而且还可改善池底环境，防止养殖品种出现浮头等情况。
(2)南美白对虾养殖的疾病防治：
①台风、暴雨过后，不要一下子大量排去淡水、加进海水，这样反而对南美白对虾不利，应该使池水有一个逐渐咸化的过程。关键是消毒海水，每天排去20～30厘米塘水，再加满海水，逐步恢复到原来的海水养殖。在添加海水时开动增氧机，既增加水体溶氧，又打破海、淡水分层现象，使海、淡水充分混合。
②消毒池塘水体，投放水质、底质改良剂，向水体泼洒有益微生物制剂，在饲料中添加Vc、免疫多糖、保肝健、免疫多肽等抗应激营养添加剂。
③对虾饲料中应添加抗病毒药物及抗生素药物，连投3～5天，预防病毒病、细菌性疾病暴发。
(3)、网箱养殖的疾病防治：
养殖户在台风过后，应尽量采用低刺激消毒剂，如活性碘、水产用二溴海因或高锰酸钾泼洒等对鱼体消毒，可有效地防止鱼体因擦伤所引起的体表溃疡、烂皮烂尾等继发性疾病。如果情况严重，对摩擦、堆挤受伤的鱼进行药浴治疗是十分必要的：将受伤的鱼集中捞到一个网箱或大桶中，以土霉素25克/立方米的剂量，浸洗30分钟左右;后以5-7.5克/100公斤鱼体重的剂量拌饵投喂，每日1次，连续5-7天。同时，在投喂新鲜饲料的过程中，适量添加免疫多糖、复合维生素C、矿物质以及活性物质等营养物质，增强鱼体的抵抗能力，内服抗菌素、大蒜素等药物进行必要的预防。及时清理受灾网箱，对存留在网箱底部的污染物和死鱼要及时捞出，并按网箱登记死亡鱼的数量、重量，以便过后补放苗种。
(4)淡水养殖的疾病防治：
养殖户在台风过后，需特别留意池水溶解氧的变化，特别是池底溶解氧的不足的时候，应增加增氧机的增氧时间，必要时，在晚上8点钟左右，投放一些增氧剂。这不仅可以增加池塘底部的溶解氧，而且还可改善池底环境，防止养殖品种出现浮头等情况。同时建议在台风暴雨前后，往饲料中添加复合维生素C、免疫多糖等营养类物质，以增强养殖品种的抗应激能力。对pH值在8.5以内的池塘，可泼洒生石灰，平均水深在1.5-2.0米的池塘，每亩用生石灰 10公斤，化浆水后全池泼洒，以调节养殖水体的pH值。对水质变清的池塘，池塘中可投放生物菌肥、复合肥料等，以保持池塘有足够的肥度及藻相和菌相的平衡。对水质过浓，池底有机质含量过多的池塘，建议使用微生态制剂、底质改良剂等，以改良池塘水质和池塘底部的生态环境。但在使用微生态制剂的同时，必须开动增氧机，避免缺氧。
(5)、寄生虫的防治：
台风过后水温回升很快，加上养殖池内水质突变，养殖的水生动物很容易发生寄生虫病，可用纤虫净、纤虫嘉、混杀王等高效药物杀灭虾蟹体表的寄生虫;鱼类鳃部、体表也易发寄生虫，可选用敌百虫、硫酸铜、中药敌鱼虫等进行杀灭。
(6)、死体处理：对于动物死体一定要及时深埋处理，并做好隔离的各项工作，防止腐烂传播疾病。
三、其它工作：
1、水质管理 ：海淡水养殖池塘待外围水位下降后及时换水并调整正常水位。海水池塘因降雨量大盐度急降应尽快排淡，换入新水，海水倒灌的淡水池塘则尽快排咸、灌淡。并及时施肥培养水质，施肥要在少施勤施的基础上，注意看天、看水进行施肥，使水色达到鲜活嫩爽。同时用生石灰等调节池水的PH值，使淡水养殖池的PH值控制在6.5-7.5，海水养殖池的PH值控制在7.8-8.6。
2、饵料管理：因受环境突变，养殖生物体应激大，灾后应加强投喂优质饵料。鱼虾蟹类应投喂优质全价配合饵料或鲜活饵料，提高机体的抗病力。投饵要实行“四定”的原则，即定时、定位、定质、定量。投饵量要根据天气、水质和鱼虾吃食情况灵活掌握。一般天气晴朗可多投，阴雨天可少投，天气闷热雷雨之前应停止投饵。水色好，水质肥爽，可正常投饵，水色淡可增加投饵量，水色过浓则应减少投饵量并应及时注入新水，网箱养鱼争食激烈可正常投饵，上浮鱼群减少，争食不激烈时，可减少投饵量;鱼病治疗期间投饵量应适当控制。
对滤食性鱼类、贝类的养殖池塘应及时调控水色，透明度控制在30-40厘米，水色保持鲜活嫩爽，颜色以黄褐色、棕黄色、浅绿色为好。对水色过浓的池塘，可配合防病害定期使用漂白粉或水质改良剂，降低浮游植物的生物量。滩涂贝类养殖要疏通沟道，养护好涂面，确保涂面基质稳定。
3、及时补放苗种：修复或新建的网箱待水质稳定后，购买
